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年度大数据 | 国产自主平台的25000例高深度WGS分析

2019-01-03



中国深圳,12月29日,基于华大智造测序平台的第2万5千例高深度人类全基因组测序(Whole Genome Sequencing, WGS)云端分析在BGI Online基因云平台完成。作为基因大数据时代的“算力”引擎,这一分析量在业内创造了最新记录。


BGIOnline 平台WGS分析量趋势图


BGI Online从2017年开始全面支持包括BGISEQ系列测序仪在内的多种测序平台的数据云端分析与交付,用户可根据不同平台和数据定制分析流程,保证分析通量的同时满足灵活性需求。同时,BGI Online平台的公共资源中也发布了瓶中基因组NA12878标准品的BGISEQ测序数据,供广大研究者分析和下载使用。


今年5月,BGI Online平台WGS累计分析量第一次突破10000例。4个月之后,再次突破第二个10000例。截止发稿日,基于国产自主平台BGISEQ系列基因测序仪,已累计完成高深度WGS云端分析25000+例。强大的基因大数据处理能力,得益于BGI Online平台不断提高的处理通量和分析效率,以及高性价比的分析成本和便捷的数据交付。目前,BGI Online平台已具备全流程自动化、全球云端快速部署、覆盖全球网络数据交付的能力。


“不仅仅是高通量,还有高性能、高速度,这是基于国产自主平台的25000例高深度WGS云端分析创下的‘新三高’。” BGI Online平台负责人金鑫博士介绍道,“在通量方面,WGS分析并发量达500例,月分析量最高2853例,总数据处理量超7PB;在性能方面,服务可用性达99.9%,分析任务成功率超98.5%;在速度方面,基于FPGA硬件加速的MegaBOLT分析流程也已上线BGI Online,极大提高分析速度,30× WGS分析时间最快3.5h。”

传送门:? 新品第四波 | MegaBOLT——让基因测序仪集体提速!


华大智造首席运营官蒋慧博士表示,“国产自主平台,包括测序平台和基因云平台等多个平台,需要行业的力量整合在一起、无缝衔接,才能最有效地为基因科技的研究和产业提供最根本的革新动力。”基于华大智造测序平台产生的WGS数据具有高质量值,GC含量稳定,高比对率,低重复率等优势。


BGISEQ WGS 50例人样品数据平均结果


近日,UK Biobank在其官网上公布了使用华大基因自主平台测序的50例英国人样品WGS数据和分析报告。此次公布的数据为2018年初UK Biobank为了测试华大智造自主平台WGS数据质量而提供的48例英国人样品和双盲测试的两个重复英国人样品的数据。华大基因在为客户和合作伙伴提供基因数据测序和分析服务时一直非常重视数据隐私和安全保护。此次所有公布样品数据的处理、测序、分析及交付全流程均严格遵守数据隐私和安全保护原则。对满足UKB质量要求的数据进行公开,是对全球顶尖测序平台技术及服务质量的认可。研究者可以根据UKBiobank官网的指导(http://www.ukbiobank.ac.uk/uk-biobank-access-management-system-ams-user-guide-getting-started/)申请数据下载,审核通过后即可下载全部50个样品数据。


关于BGI Online

BGI Online是一款强大且安全的基因云平台,贯穿基因数据流“存、算、传、管”各个维度。平台基于强大的云计算与无限的云存储能力,为各大测序服务商、研究机构等提供更简单、更高效的数据存储、自动化分析、数据传输、项目协作以及生物信息工具开发等方面的解决方案。如欲了解更多关于平台相关信息,请访问BGI Online官网www.bgionline.cn。



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