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NGS技术下的传染病诊断和抗生素耐药性鉴定解决方案

2018-11-23


2018年10月25日,在华大智造主办的ICG-13同期卫星会——基因组学技术与应用研讨会(TACG)上,Ares Genetics公司首席执行官Andreas E. Posch博士就华大智造与Ares Genetics的合作项目发表了演讲,该项目旨在开发基于NGS技术的传染病和抗生素耐药性诊断解决方案。


“目前,耐药感染影响了数百万人” Posch博士在演讲中提到,“但诊断检测缓慢且不完整,导致50%以上的患者得不到充分治疗,每年约有70万患者死于这些感染。”



针对迅速出现的抗生素耐药性问题,德国Curetis和华大智造在ICG-12上宣布双方将基于NGS技术,合作研发传染病诊断及抗生素抗药性鉴定的解决方案。在今年ICG-13的TACG会议上,Posch博士展示了将Curetis Unyvero L4 Lysator细胞裂解仪、华大智造基因测序仪和ARES的抗生素耐药性数据库(ARESdb)结合起来后,传染病诊断和抗生素耐药性鉴定方法的研究取得的显著进展。


Posch博士解释说,完整解决方案将包括以下步骤:

1.使用Curetis UNYVERO L4 Lysator处理病人的原始样本。

使用UNYVERO L4 Lysator,所有患者的原始样本(如痰液、灌洗液、抽出物、组织/骨头、胃液、点状物质、引流等)都能够被可靠处理,取代了繁琐且耗时的传统人工方法。


2.采用华大智造基因测序仪进行高质量的细菌DNA测序。

通过MGISP-100自动化样本制备系统、华大智造基因测序仪,可以实现高灵敏度、高特异性的DNA测序。对细菌de novo组装的结果显示,华大智造测序仪的性能与Illumina相近。


3.ARESdb提供自动化报告

ARESdb是世界上最大的抗药性基因标记和预测抗生素耐药性panels的知识库和识别引擎。ARESdb能够从NGS原始数据中识别病原体序列,准确率高于99%,抗生素耐药性检测准确率高达98%以上。

相较于其他自动化技术及手动操作方法,华大智造和Curetis的全自动基因测序解决方案更为可靠,该方案具有高灵敏度的特点,并可以在24小时内提供报告。



2017年开始合作以来,华大智造和Curetis 一直致力于整合UNYVERO L4 Lysator 细胞裂解仪与华大智造基因测序仪,设计工作流程,并将DNBseqTM技术与ARESdb技术相结合,进行病原体和抗生素耐药性检测。在今年的TACG上,双方宣布将基于ARESdb,继续致力于NGS分析和应用的开发和验证,最终实现UNYVERO L4 Lysator 细胞裂解仪与华大智造基因测序仪的无缝整合。“我们的目标是实现自动处理任何类型的样本,并且自动测序和自动识别,迅速提供识别报告,促进精确治疗。” Posch博士说。


关于Curetis

Curetis 创立于 2007 年,致力于打造可靠,快速,高性价比的严重传感染疾病诊断的相关产品。迄今为止,Curetis 已在阿姆斯特丹、布鲁塞尔的欧洲证券交易所及私人投资上成功获得 1.078亿欧元的融资。


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