1.基本信息
碱基分布
碱基质量分布
质控结果
| 样本 | DNBSEQ_PCR-Free_PE150_128Gbp
|
|---|
| Read长度 | 150:150 |
| 原始Read数 | 841,160,794 |
| Clean Read数 | 840,315,972 |
| Clean Read比例 | 99.9% |
| 原始Read Q20 | 96% |
| 原始Read Q30 | 86.76% |
| 原始Read GC比例 | 41.07% |
| Clean Read Q20 | 96% |
| Clean Read Q30 | 86.75% |
| Clean Read GC比例 | 41.07% |
2.比对信息
插入片段
深度分析
GC偏好
比对结果
| 样本 | DNBSEQ_PCR-Free_PE150_128Gbp
|
|---|
| 比对率 | 99.95% |
| PE比对率 | 99.92% |
| 重复序列比例 | 0.97% |
| 错配率 | 0.75% |
| 插入片段 | 404.8 |
| 平均测序深度(去除重复) | 42.48 |
| 覆盖度(>=1X) | 99.10% |
| 覆盖度(>=2X) | 99.01% |
| 覆盖度(>=3X) | 98.95% |
| 覆盖度(>=4X) | 98.89% |
| 覆盖度(>=5X) | 98.83% |
| 覆盖度(>=10X) | 98.50% |
| 覆盖度(>=20X) | 97.06% |
| 覆盖度均一性(>0.2f) | 98.57% |
3.变异分析
变异统计
| 样本 | DNBSEQ_PCR-Free_PE150_128Gbp
|
|---|
| SNP个数 | 4,028,217 |
| dbSNP比例 | 95.16% |
| 未知SNP | 194,913 |
| 未知SNP比例 | 4.84% |
| Ti/Tv | 1.99 |
| INDEL个数 | 957,538 |
| dbINDEL比例 | 78.83% |
