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华大智造携手10x Genomics:单细胞RNA测序技术不止步!

2019-05-22

2019年5月20-22日,华大智造受邀参加由日本理化学研究所(RIKEN)在日本东京主办的欧洲分子生物组织(EMBO)单细胞生物学研讨会。5月21日,华大智造联合RIKEN献上了一场精彩的卫星会。会议期间,华大智造宣布将与10x Genomics 公司共同致力于为用户提供单细胞测序的完整解决方案。

华大智造利用其全新的文库转换技术与10x Genomics 的 Chromium系统相配合,最终达成了10x Genomics 公司的单细胞测序技术与MGISEQ平台及BGISEQ平台完美兼容。


目前,基于华大智造测序平台产出的单细胞RNA数据已分别被英国Wellcome Sanger研究所和位于澳大利亚悉尼的Garvan医学研究所所验证。两项研究均旨在评估华大智造与市面其他同类产品在单细胞RNA测序技术方面的表现。分析结果表明,华大智造产出的测序数据具有可比性,且成本更低。华大智造独有的DNBSEQTM技术具有高准确性、低重复序列率、低标签跳跃的重要特性,可始终扩增原版DNA,避免错误积累,并兼具测序信号强度和准确性,以实现最高效准确的大规模并行测序。


华大智造首席运营官蒋慧表示:“基于DNBSEQTM的测序技术,单细胞RNA测序在华大智造平台上的数据表现十分出色,相信与10x Genomics 公司的合作将为客户提供更有价值的解决方案。我们的文库转换技术也将在未来有更广阔的应用,现在仅仅是个开始。”


在5月21日的智造卫星会议上,来自英国Wellcome Sanger 研究所的Sarah Teichmann 博士和 Kedar Natarajan博士也展示了今年4月份发表在Genome Biology 的研究成果【1】。该项研究分析基于DNBSEQTM技术的华大智造测序平台数据表现优异,与Illumina 相当。


早在今年2月份,另外一项研究也得出了类似的结论。Garvan 医学研究所与华大团队共同分析了在10x Genomics 平台上的7万多个单细胞,并使用MGISEQ-2000,Illumina NextSeq 500和NovaSeq 6000进行测序。研究结果表明,MGISEQ-2000和NovaSeq的数据具有可比性,而MGISEQ-2000的表现优于NextSeq 500,可以识别更多的细胞、基因和UMI,该项研究结果已于今年2月份公开发布在BioRxiv上【2】。


2018年1月,华大智造在10x Genomics公司的Compatible Certification Program中共同探索单细胞测序技术。一年多的时间过去,越来越多的实验结论已经证实了华大智造测序平台的表现,我们也能十分清晰地看到,MGISEQ与BGISEQ 测序平台已展示出其开放性与兼容性,同样的,10x Genomics平台也是如此。


华大智造提供的单细胞生物学兼容解决方案证明了其 DNBSEQ文库与市面上现有的测序应用可以兼容,相信未来华大智造也绝不会止步于此,将持续推动创新,不仅对其他的单细胞生物技术兼容,而且通过其通用转换技术为肿瘤检测、外显子测序和传染感染疾病检测提供有效且经济实惠的解决方案。


参考文献

[1] Kedar Nath Natarajan etal. Comparative analysis of sequencing technologies for single-cell transcriptomics【J】Genome Biology,2019

[2] Anne Senabouth etal.Comparative performance of the BGI and Illumina sequencing technology for single-cell RNA-sequencing[J]bioRxiv,2019


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