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重磅!国际“百万微生态”计划在深启动,将构建全球最大人体微生物组数据库

2019-10-25


20191026日,“百万微生态”国际合作计划(MMHP)在深圳第14届国际基因组学大会(ICG-14)上正式启动,来自中国、瑞典、丹麦、法国、拉托维亚等多国科学家将合作开展微生物宏基因组研究,致力于在未来三至五年内对100万份来自肠道、口腔、皮肤、生殖道等器官的微生物组样品进行测序分析,绘制人体微生物组图谱,构建起全球最大的人体微生物组数据库。



在启动仪式上,瑞典卡罗林斯卡医学院转化微生物组研究中心主任Lars Engstrand教授、上海瑞金医院-中国国家代谢疾病临床研究中心刘瑞欣研究员、华大集团首席执行官兼华大生命科学研究院院长徐讯发表致辞,并和华大智造总裁余德健及华大生命科学研究院执行院长侯勇等共同宣布计划启动。瑞典皇家工程院院士Mathias Uhlén教授、中国国家代谢疾病临床研究中心主任宁光院士发来祝贺。


多国联合开展“百万微生态”研究


据悉,“百万微生态”国际合作计划(MMHP)也是目前全球规模最大的国际微生态研究计划,由瑞典卡罗林斯卡医学院、中国国家代谢疾病临床研究中心、丹麦哥本哈根大学、丹麦技术大学、法国国家农业科学院宏基因组研究所、拉脱维亚分子生物学研究所和深圳华大生命科学研究院等机构联合发起,旨在通过华大智造独家提供的DNBSEQTM微生物宏基因组测序技术,绘制不同种族、年龄、性别以及健康状态下的人体微生物图谱,建立大规模人群水平的微生态研究基线,从而推动人体微生态领域的前沿转化医学研究。


对此,上海瑞金医院-中国国家代谢疾病临床研究中心刘瑞欣研究员说:“通过更大规模的研究人体微生物组在正常与病理状态、疾病治疗前后的变化、解析其对人体代谢与健康作用机制,可在未来为代谢性疾病、肿瘤、生殖健康和新生儿等多领域的新疗法提供更多可能” 。

作为计划发起方之一,瑞典卡罗林斯卡医学院转化微生物组研究中心(CTMR)主任Lars Engstrand教授在启动仪式上表示:百万微生态计划将完成百万样本规模的人体微生物组图谱,这将为当前微生态领域研究奠定坚实的数据基础”。


据悉,作为宏基因组研究领先的基础科研机构,华大生命科学研究院将为该项目中20万份样本提供相应的科研平台和分析资源。华大集团首席执行官兼华大生命科学研究院院长徐讯博士表示,与个体基因组一样,人体微生物组与个体健康密切相关。尽管目前全球学者在该领域发表了大量科研论文,然而作为当今生命科学最热门的研究领域之一,国际上却缺乏大规模、标准化的人体微生物组开放数据库及研究共享框架,极大地限制了该领域的研究和交流。通过多国合作实施“百万微生态”这一超大规模研究计划,构建起全球最大人体微生物组数据库,将有力地促进该领域的基础研究和国际交流,对后续产业化应用也具有重要意义。


华大智造提供高通量测序技术支持


目前,依托华大智造测序技术和平台,“百万微生态”国际合作计划(MMHP)已完成首批1万个样本的宏基因组测序。该批数据由中国国家代谢疾病临床研究中心、瑞典卡罗琳斯卡医学院、法国国家农业科学院宏基因组研究所及华大生命科学研究院等多家科研机构联合开展的微生态分析得出,其数据质量获得了各国科学家一致好评,这也为后续10万和100万样本的人体微生物组图谱的绘制奠定了坚实基础。该项目数据将严格遵循国际数据安全管理规定进行存储和研究使用。


据了解,今年6月瑞典卡罗林斯卡医学院转化微生物组研究中心与华大智造达成战略合作,引进其高通量测序平台。卡罗林斯卡医学院是世界顶尖医学院之一,负责评审每年的诺贝尔生理学或医学奖,其转化微生物组研究中心涵盖生物学、临床和流行病学的研究。该研究中心主任Lars Engstrand教授表示,通过华大智造的测序平台,他和团队将原来的微生物组学研究从16SrRNA基因扩增子测序升级到了Shotgun宏基因组测序,我们还将华大智造的DNBSEQTM技术与其他测序技术进行了全面对比,其产出的数据质量令我们感到惊喜,这正是我们最想要的平台。”

“微生态”研究应用新的里程碑


近年来,随着基因组学相关技术的迅速发展,微生物组研究已成为全球生命科学研究的热点。2008年,欧盟发起了“人类肠道宏基因组计划”(MetaHIT),其一系列研究成果先后在《自然》等国际顶级杂志发表,这为国际微生物组研究合作开创了先河。华大作为唯一加入该计划的非欧盟国家机构,在研究平台和技术中发挥了重要作用。


此次由瑞典卡罗林斯卡医学院、中国国家代谢疾病临床研究中心与华大等机构共同发起的国际“百万微生态”研究计划,将人体微生物组从肠道拓展到更多共生部位,同时样本规模提升到百万级,将成为继MetaHIT之后国际微生物组研究合作的又一个里程碑。


据了解,“百万微生态”国际合作计划还公布了其公共邮箱(mmhp@genomics.cn),欢迎更多相关领域机构进一步交流与合作,以共同推动微生态领域的研究和应用。

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