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破解疫情困局,实现精准检测!华大智造新冠病毒整体解决方案加快疑似样本检测速度

时间:2020-02-06作者:华大智造阅读数:971分享

华大集团联合创始人兼董事长汪建在春节期间亲历武汉疫情防控一线后提出:“在注重临床抢救的同时,把精准检测和诊断视为同等重要:快速建成万例通量的检测中心。”


在此背景下,2月5日,在武汉市新型肺炎防控指挥部部署下,每日可检测万人份样本的新型冠状病毒应急检测实验室——“火眼”实验室正式启动试运行。该实验室的投入使用将在极大程度上缓解新冠病毒诊断压力,有利于破解疫情困局。华大智造新冠病毒高通量自动化设备和测序仪在经过疫情检测一线“实战”考验后,也将在“火眼”实验室投入使用。


武汉“火眼”实验室正式投入试运营


华大智造新冠病毒检测解决方案:自动化核酸提取+高通量测序双管齐下


在疫情防控进入攻坚阶段之际,高通量精准检测可为发热病人确诊、高危人群排查、疑似病例甄别、阳性感染者“早发现、早隔离、早诊断、早治疗”提供精准判断依据。


目前一线应用的新冠病毒检测技术PCR方法可对病毒进行筛查,适用于对患者样本中是否存在新冠病毒进行诊断;而高通量测序技术则更为全面,除了可以用来诊断新冠病毒是否存在之外,还可以对病毒进化来源、致病病理机制和病毒变异情况进行研究与分析。更为关键的是,它还能检测出包括新冠病毒在内的所有病原体以及病原体的全基因序列,这对重症患者的诊断和治疗具有重要意义。为实现高通量精准检测,急需构建高通量病毒核酸检测和配套测序能力。



应对一线疫情检测需求,华大智造提供2019-nCoV检测解决方案,不仅可针对实时定量反转录酶联反应法(RT-PCR)提供一站式自动化核酸提取解决方案,还可针对高通量测序需求提供通量灵活的基因测序仪。


据了解,该解决方案除了在武汉“火眼”实验室应用外,也已在中国国家疾控中心和各地疾控部门实现不同程度的应用,为加快疑似病例的检测与确诊,有效缓解各地疑似样本的积压情况提供了有力的工具支撑。


病毒核酸自动化提取:一站式样本处理实验室,加速病毒检测


当前,在新型冠状病毒检测中,疑似样本的病毒核酸提取大多采用人工操作,这已成为制约样本检测提速的最大“瓶颈”,也加大了一线医务人员病毒感染的潜在风险。


为实现病毒核酸自动化提取,华大智造2019-nCoV检测解决方案可提供MGISP-100及MGISP-960两种自动化样本制备系统,同时可配套病毒RNA的提取试剂和耗材。该方案在样本处理过程中具有通量灵活、快速自动、强大拓展性等特点,上机后完全无人工干预,可在1小时实现自动化核酸提取,一站到位,安全防控。



其中,MGISP-100是全球首个获得临床二类医疗器械证的自动化样本制备系统,可提取8-32样本/40-80分钟,每次可减少医务人员约2个小时的手工操作时间,适用中小型实验室。


MGISP-960则为高通量自动化样本制备系统,已获得NMPA认证,其自动化程度更高,每小时可提取36-96样本,1人可同时操作2台,操作效率大幅提升,适用于企业、临检、医院等领域的中高通量用户。为满足目前大规模人群、高通量筛查的紧急需求,MGISP-960的通量还可升级为192样本/80分钟。




此外,该方案还配置了紫外和HEPA高效空气过滤系统,可用于每天杀菌消毒和清洁,并可适配目前主流的新型冠状病毒核酸检测试剂盒(荧光PCR法),以及第三方磁珠提取试剂盒和文库构建流程。


高通量测序:有效提高阳性率,监测可能存在的变异


除了提供病毒核酸自动化提取设备外,华大智造2019-nCoV检测解决方案还可提供高通量测序方法及多款设备。



目前,新型冠状病毒溯源、流行、变异规律、变异监测、分子流行病学、人类感染的发病机理等尚待进一步明确。病毒在传播过程中可能会发生变异,并在一定程度上将影响RT-PCR的敏感性,采用高通量测序方法则可弥补这一缺点,并监测到可能的病毒变异。部分病毒含量较低的样本,在低于RT-PCR最低检出限时,采用高通量测序方法则可以提高阳性检出率,避免漏检和错检;对于疑似感染、多重感染或继发感染病原,采用高通量测序方法则可进行并发检测,提供更多可能感染的病原信息。


从快速测定未知病原,到快速鉴定已知序列,再到阳性样本的结果确认以及可能存在的序列变异动态监控,都可以采用高通量测序方法有效应对。华大智造2019-nCoV检测解决方案包含多款基因测序仪,均已通过国家药品监督管理局审批上市,可用于临床鉴别诊断包括新型冠状病毒在内的其他冠状病毒和呼吸道病原感染,快速检测病毒序列,并为监测可能存在的病毒变异提供工具和平台支撑。


根据样本数量、测序数据量和运行通量的需求,华大智造高通量测序解决方案可提供多平台适配,包括DNBSEQ-G系列(MGISEQ-200、MGISEQ-2000/2000FAST),以及DNBSEQ-T系列(DNBSEQ-T7)等多款机型,以用于疫情防控。



面对不明发热、不明病因、无法确诊的个别样本检测需求时,可选用DNBSEQ-G系列基因测序仪(MGISEQ-200、MGISEQ-2000FAST等机型),它能在24小时内快速鉴定,为进一步进行序列分析和病毒演变提供数据支持。


面对多例疑似样本检测需求,可选择MGISEQ-2000平台,其单次运行支持32个样本同时上机。面对大量疑似样本快速鉴定需求时,可直接选用DNBSEQ-T7。作为目前全世界日通量最高的测序仪,DNBSEQ-T7可在5-6小时内支持128例样本同时上机测序(测序策略:SE50),从样本到数据分析结果,不超过20小时。


双管齐下,对症施“测”。应对疫情发展,华大智造将全力投入,通过技术、设备和人员支撑,为各地疫情防控实现高通量精准检测提供保障。