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MGISEQ-200助力CRISPR基因编辑系统的特异性精准开发

时间:2020-05-19作者:华大智造阅读数:300分享

近日,北京大学神经科学研究所的科学家们在Science Advances 杂志发表了题为Development of a CRISPR-SaCas9 system for projection-and function-specific gene editing in the rat brain的研究论文。该研究基于CRISPR-SaCas9技术,结合腺相关病毒和细胞标记技术,以功能特异性模式实现基因编辑,在实验大鼠的脑中实现了特定记忆的精准删除。


在研究中,研究人员对基因编辑靶点和潜在的脱靶位点进行扩增建库并使用基因测序仪MGISEQ-200对扩增产物进行深度测序。测序数据分析结果显示:潜在脱靶位点相对于基因编辑靶点在indel发生率方面至少低两个数量级(图1),同时在单细胞水平上对基因编辑后靶点区域的indel信息进行了验证(图2)。与以往的相关研究报道一致,SaCas9对DNA错配有较高的抗性,在体内能够保证高的靶点特异性。


图1 基因编辑靶点和潜在脱靶位点序列及indel发生率



图2 基因编辑靶点序列及基因编辑后测序结果展示


作为一款小型化的桌面型基因测序仪,MGISEQ-200小巧、灵活,应用广泛,支持基于杂交捕获或多重PCR扩增的靶向测序、小型基因组测序、低深度全基因组测序等多种应用。目前,通过MGISEQ-200获得测序数据并由此展开深入探讨的相关研究已陆续见刊。其中,基于MGISEQ-200深度测序的新冠病毒转录组结构研究于4月份登上了Cell杂志,为全球科学家的后续研究提供参考和依据。


小贴士1  MGISEQ-200发表的文章(精选)


[1] 一例基孔肯雅病毒和寨卡病毒混合感染病例的发现.华南预防医学.

DOI: 10.13217/j.scjpm.2019.0481

[2] Devolopment of a CRISPR-SaCas9 system for projection and function-specific geneediting in the rat brain. Science Advances.

DOI: 10.1126/sciadv.aay6687

[3] Thearchitecture of SARS-CoV-2 transcriptome. Cell.

DOI: 10.1016/j.cell.2020.04.011



小贴士2 MGISEQ-200操作演示(请点击链接观看)

http://1258877295.vod2.myqcloud.com/fe52eac0vodtranscq1258877295/67d66e4d5285890801625649181/v.f40.mp4

【注:MGISEQ-200已在海外部分国家和地区更名为DNBSEQ-G50】