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可鉴病毒,能追“真凶”!华大智造方舱+测序实验室双平台合力助推海口抗疫

时间:2021-01-28作者:华大智造阅读数:337分享

1月28日,华大智造“移动核酸检测+基因测序”双平台在海口投入使用。双平台分两个实验室运行,分别是方舱实验室与测序实验室,这两个实验室可以单独使用,也可共同“奋战”不仅能为海口市提供大规模核酸检测,还帮助海口市破解病毒全基因组序列,为当地春节疫情防控提供支持。


新冠病毒传播范围越广,发生变异的机率就越大。在保证大范围核酸检测的同时,破解病毒全基因组序列,监控病毒变异显得非常重要。1月20日,国务院联防联控机制印发《关于进一步做好当前新冠肺炎疫情防控工作的通知》,要求各地要对核酸检测能力再摸底、再提升,同时完善病毒基因测序能力布局。


华大智造积极响应国家号召,将方舱实验室与基因测序平台结合,形成了“移动核酸检测+基因测序”双平台,双平台分两个实验室运行,分别是方舱实验室与测序实验室。当中方舱实验室可以灵活布置到车站、港口、社区等场所,满足大通量的检测需求。测序实验室可以监控病毒变异,为后续疫情防控工作提供有效依据。





海口市疾控中心微生物检验科副科长李平介绍,方舱实验室占地34平方米,里面分为试剂准备区、标本制备区、扩增分析区和高压消毒区。通过基因扩增方法,可以完成一站式核酸检测,大大提高检测效率,可以有效应对大规模人群的核酸检测需要。


方舱实验室每个班次需4人至5人操作,不混样检每日检测6000人次,混样(10混1)每日检测6万人次。检测高通量得益于配备了由华大智造自主研发的全自动MGISTP-7000分杯处理系统、自动化设备MGISP-960以及实验室信息管理系统MGI ZLIMS组合而成的一站式平台。可以实现全自动化样本条码扫描、录入和分装程序,自动化提取核酸并实时监控管理核酸检测全过程。


                  海口“移动核酸检测+基因测序”双平台


1.高通量日通量:6000(不混样),6万(混样:10混1)——方舱实验室

先进的自动化设备和系统代替了人工。配备了全自动MGISTP-7000分杯处理系统、自动化设备MGISP-960以及实验室信息管理系统MGI ZLIMS。


2.监控病毒变异——测序实验室

绑定了华大智造自主研发的基因测序平台,能破解病毒全基因组序列,配备了自动化样本制备系统MGISP-100、高通量基因测序仪MGISEQ-200、PFI病原感染快速鉴定系统。


3.更快速——方舱实验室

集装箱改造而成,方便车载运输,可根据疫情防控所需,灵活布置到车站、港口、社区等场所。大大减少了样本运送流转的时间, 减少了患者的流动,较好的控制疫情。


4.安全可靠——方舱实验室

符合加强型二级生物安全实验室标准。整体负压,该实验室设置试剂准备间、样本处理间、检测间三个主检测功能区。同时配套进、出更衣室及高压消杀设备和空调及机电室。人员单向流,各实验区之间采用传递窗及缓冲间隔离,防止气溶胶污染。


测序实验室里面装备了华大智造自主研发的基因测序平台。该基因测序平台可以“连线”方舱实验室,里面配备了华大智造自动化样本制备系统MGISP-100、高通量基因测序仪MGISEQ-200、PFI病原感染快速鉴定系统。样本在方舱实验室被确定为阳性样本后,可以通过基因测序平台快速、准确、全面地将病毒进行分类鉴定,同时提供完整的病毒基因序列信息。



新冠疫情爆发至今,华大智造对于破解病毒全基因组序列,监控病毒变异的研究早已积累了丰富的经验。早在2019年12月,在最早一批提交至全球共享流感病毒数据库GISAID发布的13例新型冠状病毒基因组序列数据中,有5例数据来自华大智造高通量测序仪,这为研究分析新型冠状病毒的进化来源、致病病理机制提供了第一手资料。


新冠疫情爆发,华大智造紧急部署2台DNBSEQ-T7超高通量测序仪运达武汉,配合MGISEQ-2000,第一时间获得病毒的全基因组序列,为后续疫情防控、试剂盒开发、疫苗研发提供了有效依据。


中国疾控中心周刊


2020年12月,华大智造高通量测序仪——MGISEQ-200助力海关发现了海外变种的新冠毒株。国家疾控将此境外输入性病例定义为中国监测到的首例英国变种VUI-202012/01病毒株。