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华大智造-倪鸣专访:让基因测序仪成为在科研人员手边的工具

时间:2021-07-09作者:华大智造阅读数:3803分享

以下文章来源于MDx News ,作者Lemon


IDD 2021第感染性疾病诊断技术创新论坛(2021年7月15-16日·武汉)组委会有幸在大会前采访到华大智造高级副总裁、青岛华大智造总经理 倪鸣博士,并在本次采访中分享了华大智造测序平台的核心技术、创新产品及应用优势。






倪鸣博士,华大智造高级副总裁、青岛华大智造总经理。作为最早加入华大自主测序平台硬件研发成员,从2013年至今参与了多个华大测序技术平台的搭建。


IDD 2021组委会

倪博好,您从2013年至今参与了多个华大测序技术平台的搭建,可以给我们简单介绍一下么?


倪鸣

2013年我们收购了美国CG公司,之后我们在研发层面围绕DNBSEQTM核心技术做了诸多优化和升级。升级后的DNBSEQTM技术在准确率和数据利用率上具备显著的优势。


DNBSEQTM技术中,我们采用滚环复制扩增的方式,对DNA信号进行放大,无错误累积,使得华大智造测序平台具备更高的准确率、更低的Dup率(Dup率越低数据利用率越高)。同时,我们在光学、机械、电子、流体、算法等方面通过持续的技术升级与迭代,使得测序技术不断提升。


依托DNBSEQTM核心技术,华大智造陆续推出了中高通量基因测序仪MGISEQ-2000、中通量基因测序仪MGISEQ-200、高通量基因测序仪DNBSEQ-T7,以及超高通量测序系统DNBSEQ-Tx系列,能够满足不同类型的用户在各自应用场景中的使用需求,逐渐收获了来自全球用户的认可和好评。这次,我们将要带来最新的便携式基因测序仪DNBSEQ-E5,最快可4.5个小时输出下机数据(测序读长:SE50),对特殊样本的紧急测序需求能够给予即时响应,是我们对更小通量的基因测序仪产品的全新尝试。


IDD 2021组委会:

关于您提到的DNBSEQ-T7,是一款高通量的基因测序仪,那么这次带来的DNBSEQ-E5便携式基因测序仪是一款什么样的机型?


倪鸣:

基因测序仪是我们认识生命、认识世界的一个工具。DNBSEQ-T7以及我们在此基础上推出的DNBSEQ-Tx系列超高通量测序系统,加快了百万级、千万级的大人群基因组研究的推进。同时,我们也意识到应该进一步的降低基因测序仪的入门门槛,使基因测序技术和现在大家都比较熟悉的核酸检测技术一样,成为更普遍的工具之一。为此,我们在2019年发布DNBSEQ E系列测序仪并开放机型定制化。DNBSEQ E系列测序仪单机和一台笔记本电脑占用的桌面面积差不多,一名实验人员一只手就可以拎起来、抱着走,也不需要额外准备严格温湿度控制的实验室空间,实验操作很简单,十分钟之内就可以完成准备工作开始运行,进行现场测序。


这次会议上我们将要带到现场来的DNBSEQ-E5便携式基因测序仪是华大智造E系列基因测序仪首款面向终端用户上市的标准化产品。可以满足小型全基因组测序、靶向测序、病原微生物检测等多种应用需求。


IDD 2021组委会:

那么与华大智造基因测序仪的其他机型相比,这款E系列基因测序仪有哪些创新点?


倪鸣:

基于华大智造DNBSEQTM核心技术独有的技术优势,E系列基因测序仪采用了更加集成化的设计方案,测序载片集成了微流控液路系统和信号采集模块,与测序试剂盒匹配使用,测序试剂不经过仪器液路系统直接进行生化反应。


此外,在测序生化原理方面,E系列基因测序仪采用了全新的自发光体系,可以让测序载片实时读取碱基信号并转化为序列信息。基于以上两点,华大智造E系列基因测序仪本身不再需要配备传统的光学以及流体系统,体积更小,重量更轻、测序速度更快。


IDD2021组委会:

作为E系列基因测序仪的首款标准化机型,DNBSEQ-E5便携式基因测序仪在实际应用中可以发挥哪些优势作用?


倪鸣

作为一款入门级的基因测序仪, DNBSEQ-E5便携式基因测序仪是广大科研用户初次尝试测序的首选机型。同时,对于深耕测序领域的行业客户而言,DNBSEQ-E5便携式基因测序仪以其小巧、灵活的特点,可以成为现有机型的“后备队员”,可随时上场,即开即用、随到随测。


以DNBSEQ-E5便携式基因测序仪在新冠疫情期间试运行的表现为例,该机型可以部署在常规的核酸检测实验室现场,其大小与PCR仪相当,一旦发现疑似阳性样本,可以立即安排上机测序,最短10个小时就可以完成测序并直接输出病毒溯源的结果(测序读长:SE100)。


IDD2021组委会:

在疫情中,以华大智造为代表的中国企业发挥了哪些重要作用?


倪鸣

面对疫情反复、多点散发,针对大人群的群防群控、精准检测,以及深入开展的溯源研究都很重要。将疫情防控落实到位,需要做好能力建设和技术储备。


首先,华大智造的高通量测序技术在发现新病原、识别已知病原及鉴定未知病原等方面发挥关键作用。其自主研发的高通量测序仪DNBSEQ-T7、MGISEQ-2000、MGISEQ-200奔赴国内外疫情一线,与疾控中心和科研机构等单位展开紧密合作。


其次,面对多点散发、来势凶猛的疫情,华大智造研发了一系列实验室自动化设备。这些设备可以全自动扫描、录入、分装样本,自动提取核酸。整个实验过程都可以通过实验室管理系统实时监控管理,提升了大规模核酸检测的效率、保障了检测人员的安全。

特别关注

深圳华大智造科技股份有限公司,领域产品经理徐媛、高级产品经理张陆琪即将出席7月15-16日武汉举办的IDD 2021第感染性疾病诊断技术创新论坛,并分别在现场针对“华大智造核心科技助力新型冠状病毒防控”和DNBSEQTM测序平台在病原方向的应用与实践这两个话题进行各自深度分享。届时有展位展示,展位号A1。敬请关注。


参会彩蛋

会议期间特设会场至华大智造客户体验中心(武汉)参观路线,您可通过扫描下方二维码的方式预约参观,将有机会步入华大智造客户体验中心,参观DNBSEQTM主题馆集装箱式移动实验室平台体验区DNBSEQTM测序平台体验区病原高通量测序一站式平台体验区,并由领域技术专家带您了解华大智造的技术、产品以及发展近况。







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