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共同抗疫 | 华大智造DNBSEQ双平台联合出击,为厦门“清零”和疫情防控提供双重保障

时间:2021-10-19作者:华大智造阅读数:261分享

9月10日以来,福建省莆田市、泉州市、厦门市先后出现多例本土新冠病毒感染病例,29日福建本土病例实现零新增,这意味着当地疫情已经得到基本控制。10月7日21时起,厦门市中高风险地区已实现“清零”。


另据《厦门日报》10月12日报道,截至10月10日24时,厦门市疾控中心新冠病毒核酸检测已累计超87.5万管。回顾本次厦门疫情,仿佛整个城市被按下了“快进键”,在短短时间内就实现了零新增。这一成果得益于当地公共卫生体系工作人员的辛劳付出,同时也受益于此次抗疫中采用的一系列先进的自动化设备和高通量基因测序仪。


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华大智造DNBSEQ双平台联合出击

为病毒传播链提供科学依据

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在新冠病毒鉴定及诊断中,高通量测序不仅能提高阳性检出率,还能进行并发检测,提供更多可能感染的病原信息。更为重要的是,它还可以对病毒序列进行组装,获得病毒全长基因组信息,为追溯病毒来源、监测病毒变异趋势、探究致病机理提供研究基础。


据《厦门日报》10月12日报道,当地在完成繁重的核酸检测任务之余,还加班加点独立开展了新冠病毒测序工作,对厦门境外输入病例和本地疫情中的首发或早期病例做基因测序,迅速开展了病毒比对和传播链判定。目前已检测新冠病毒基因序列500多份,为动态检测病毒变异情况,研究病毒变异对病原能检测、调整防控政策提供了科学依据。


作为全球少数几家拥有自主研发能力,并能量产临床级基因测序仪的制造商之一,华大智造在此次厦门疫情中使用了DNBSEQ双平台,包括小巧灵活、性能强劲的高通量测序仪MGISEQ-200,以及另一款小型便携式DNBSEQ测序仪,它们全面满足了当地不同通量的测序需求,为厦门疫情防控提供了核心工具支撑。


华大智造MGISEQ-200小巧灵活的桌面型基因测序仪在厦门疾控中心运行中


华大智造MGISEQ-200作为一款小巧、灵活的桌面型基因测序仪,已成为小型化高通量测序实验室的“标配”。它不仅可以支持高低两种通量的载片,还可搭载3-4种读长,同时可支持单端/双端测序,并实现从10Gb-150Gb全覆盖的数据产出,完美适配病毒鉴定到溯源的不同测序方案。更重要的是,其测序质量稳定,可以为疫情防控提供可靠的数据支持。


MGISEQ-200以其灵活的特点,解决微生物测序应用中的种种难题。从快速鉴定到病毒全基因组组装再到病毒变异的溯源和进化分析,疫情发生以来,MGISEQ-200走在疫情最前线,支援全国乃至全球疫情防控。此前,MGISEQ-200平台助力山东省济南市疾控中心破解了进口冷链新冠病毒全基因组测序难题,还曾助力佛山市疾控中心成功搭建首个常态化市级测序技术平台,帮助河北、广东、黑龙江等多地疫情快速溯源。这些过往实战都为厦门疫情防控提供了宝贵的经验。


除了MGISEQ-200之外,华大智造还快速部署了三台小型便携DNBSEQ测序仪至厦门疾控,这些仪器体积小、占地少、操作简便,专为紧急现场测序打造,运送至实验室后可快速完成部署开始测序工作。该仪器与ATOPlex平台技术组成的新冠测序产品组合,可将新冠病毒测序溯源全流程压缩至约14个小时。


厦门疾控中心采用的一站式平台将新冠病毒测序溯源全流程压缩至约14个小时


厦门疫情期间,华大智造DNBSEQ双平台联合出击,既保证了大批量样本及时稳定处理,又进一步压缩了个别关键样品测序周期,为新冠测序分析、疫情防控决策提供了关键依据。