基因测序

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公共卫生事件

背景:

2016年7月23日,患者汤某在安哥拉出现发热且伴随头痛、肌肉痛、关节痛等症状,入境北京时病情严重,被送往某医院隔离治疗。7月24日,华大基因协助出入境检验检疫部门,对病例样本进行了高通量测序,在最短时间内成功获得了裂谷热病毒全基因组,为临床干预和治疗提供了依据。

方案:

广东出入境检验检疫局技术中心卫生检疫实验室和华大基因对从患者血样中提取的核酸样本进行RNA文库构建-高通量测序-病原感染快速鉴定系统分析

结果:

7月24日获得数据结果,经分析鉴定发现样本内存在裂谷热病毒(暂名RVFV-Beijing),并将获得的序列与数据库进行比对分析,发现RVFV-Beijing三个基因组片段与曾在南非卡卡马斯发现的Rift Valley fever virus Kakamas isolate的三个相应片段高度相近,相似度均为98%。

文章:

题目:Isolation and phylogenetic study of Rift Valley fever virus from the

first imported case to China

期刊名称:VIROLOGICA SINICA

发表时间:2017年6月