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MGIEasy RNA Exome 应用指南

MGIEasy RNA Exome应用主要用于人源样本的RNA编码区定量分析,该应用整合了RNA方向性文库制备和外显子捕获技术,将人源total RNA转化成已知RNA链起源方向的双链DNA分子,然后对其外显子序列进行特异性捕获,最终制备成适合于MGI高通量测序仪测序的文库,为FFPE 样本和其他低质量人源样品的mRNA表达定量测序分析提供了一种高效、完整的产品组合。

MGIEasy RNA Exome应用专注于降解样本的RNA编码区的定量分析,从total RNA中捕获RNA编码区,有助于最大限度地提高mRNA定量的精准性,且相比于非RNA Exome测序,达到相同的RNA编码区测序深度时所需的测序数据量更少。

MGIEasy RNA Exome应用产品包含了MGIEasy RNA方向性文库制备试剂套装(1000006385)、MGIEasy 外显子组捕获V5探针试剂套装(940-000187-00)和MGIEasy 外显子组捕获辅助试剂盒(1000007743),本建库操作指南将为您详细介绍MGIEasy RNA Exome文库的制备技术。



MGIEasy RNA方向性文库制备试剂套装(16 RXN)

货号:1000006385
核心建库

MGIEasy RNA方向性文库制备试剂盒 V2.0(16 RXN)

1000005270
接头

MGIEasy DNA Adapters-16(管式)试剂盒 V1.0(16 RXN,16 barcodes)

1000005284
纯化磁珠 MGIEasy DNA 纯化磁珠试剂盒 1000005278
环化 MGIEasy环化模块 V2.0 1000005260
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MGIEasy 外显子组捕获V5探针试剂套装(16 RXN)

货号:940-000187-00
探针

MGIEasy外显子组捕获 V5探针试剂盒(16RXN)

1000007741
杂交洗脱

MGIEasy 外显子组捕获杂交洗脱试剂盒(Box 1)(16RXN)

940-000168-00
杂交洗脱
MGIEasy 外显子组捕获杂交洗脱试剂盒(Box 2)(16RXN)
940-000169-00
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MGIEasy 外显子组捕获辅助试剂盒(16 RXN)

货号:1000007743
捕获辅助

MGIEasy 外显子组捕获辅助试剂盒 V1.0(16 RXN)

1000007743
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产品特点

样本低投入量
样本低投入量
Total RNA起始量可低至10 ng,且在不同起始量下文库均有出色、稳定的数据表现。
对严重降解低质量样本也能适用
对严重降解低质量样本也能适用
针对FFPE样本和其他降解严重的低质量样本也能适用,可以获得高质量数据。
专注于RNA编码区的定量分析
专注于RNA编码区的定量分析
通过外显子捕获的方式获得RNA编码区,Exon比例达60%以上,相同的RNA编码区depth所需数据量更少。
优异的重复性
优异的重复性
低质量样本建库重复性可达0.99以上。
样本低投入量
样本低投入量
Total RNA起始量可低至10 ng,且在不同起始量下文库均有出色、稳定的数据表现。
对严重降解低质量样本也能适用
对严重降解低质量样本也能适用
针对FFPE样本和其他降解严重的低质量样本也能适用,可以获得高质量数据。
专注于RNA编码区的定量分析
专注于RNA编码区的定量分析
通过外显子捕获的方式获得RNA编码区,Exon比例达60%以上,相同的RNA编码区depth所需数据量更少。
优异的重复性
优异的重复性
低质量样本建库重复性可达0.99以上。

性能参数

应用名称

MGIEasy RNA Exome

应用指导 MGIEasy RNA Exome 建库操作指南
所需试剂盒信息

MGIEasy RNA方向性文库制备试剂套装 

MGIEasy 外显子组捕获V5探针试剂套装

MGIEasy 外显子组捕获辅助试剂盒

规格

16 RXN 

所需样本量 10 ng~100 ng total RNA
样本类型 冰冻组织、FFPE样本
适用物种
建库时间

32 h 

应用方向

RNA-Seq

适用的测序平台

MGISEQ-2000

推荐的测序读长

PE100

推荐的测序深度/Raw reads数

PE100/25 M reads

推荐的MGI流程

应用类型
样本制备
测序
分析
  • RNA Exome测序

  • MGISP-100

  • MGISP-960
  • MGIEasy RNA方向性文库制备试剂套装

    + MGIEasy 外显子组捕获V5探针试剂套装
    +MGIEasy 外显子组捕获辅助试剂盒

  • MGISEQ-2000(PE100)


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