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Multiplexed Single Cell Genomics with MGI CoolMPS™ Sequencing Chemistry
时间:2019-12-17作者:华大智造阅读数:699分享
多重单细胞基因组学已被用于提高基于液滴的单细胞分析的通量,从而能够经济有效地制备数十万到数百万个单细胞的文库。多路复用(Multiplexing)可以利用来自遗传个体的自然遗传变异或基于抗体染色或脂质标签的细胞散列来分配给供体的单个细胞。这些方法的成功与否取决于新一代测序数据的质量。为了评估用COOLMPS™测序进行多重单细胞测序的表现,我们从三个健康个体制备了外周血单核细胞(PBMCs),并使用10X Genomics 3v3试剂进行了CITE-seq (Abseq, BD),、cell hashing (TotalSeq-A, BioLegend)和RNA-SEQ。文库分别使用Illumina Novaseq 6000系统和MGI的CoolMPS™测序试剂α版进行测序。我们将展示测序质量、拆分细胞标签,聚类分析及细胞鉴定的对比数据。
Ms. Gracie Gordon
Ms. Gracie Gordon
生物和医学信息学研究生课程博士研究生, 加州大学旧金山分校医学与人类遗传学研究所
PhD candidate, Biological and Medical Informatics Graduate Program, Department of Medicine and Institute for Human Genetics, UCSF

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