时空转录组FFPE产品方案(New!)
福尔马林固定的石蜡包埋(Formalin-Fixed Paraffin Embedded,FFPE)样本作为长期保存病理样本的金标准,因其保存方便,易于成片,且能较好地保存样本组织形态的特点,在医学与科研领域被广泛应用。据估计,目前全世界范围内已积累了数以亿计的FFPE样本[1]。然而,由于FFPE样本制备过程会导致RNA降解,利用Poly-T探针捕获mRNA Poly-A尾的传统转录组分析方法已不再适用,因此研究者亟需新的技术方法探究FFPE样本的组学奥秘。
时空转录组FFPE产品方案,利用“随机探针”对FFPE样本中组织细胞内的Total RNA分子进行原位捕获,并通过空间条形码(Coordinate ID,CID)还原回空间位置,可实现全物种全转录组空间表达图谱的构建,助力临床科研深入理解疾病的发生与发展机制。与常见转录组方案相比,该方案可以捕获发生降解的RNA片段,也能实现编码及非编码RNA的共捕获,以及宿主与微生物的共检测。
参考文献:
[1] Blow, N. Tissue issues. Nature 448, 959–960 (2007). https://doi.org/10.1038/448959a