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重要成果展示
该研究揭示了多种蚊虫在不同生境下病毒的多样性、传播分布的影响因素及地理谱系特征,在多维尺度上为研究蚊虫病毒组提供了重要的新见解。相关成果于3月22日在国际学术期刊《自然-生态与演化》(Nature Ecology & Evolution)上发表。研究团队基于华大智造自主研发的DNBSEQ-Tx超高通量测序平台,通过对单个蚊虫进行宏转录组测序,成功构建了迄今发表个体数最多、地域跨度最大的蚊虫病毒组数据资源。研究团队从中鉴定出393种蚊虫相关病毒,其中高达63%为潜在新种,包括3种潜在致病虫媒病毒新物种。这一发现大大拓展了已知蚊虫病毒的多样性和新颖性。
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中国科学院武汉病毒研究所联合国内多个研究团队,对穿山甲中发现的MERS样冠状病毒进行了鉴定和进化分析,首次发现了穿山甲作为蝙蝠病毒跨种传播的中间及适应性宿主的证据,相关研究文章“A bat MERS-like coronavirus circulates in pangolins and utilizes human DPP4 and host proteases for cell entry”发表在Cell上。华大智造DNBSEQ-T7、MGISEQ-2000测序平台为该研究中冠状病毒的精准溯源和进化分析提供了强有力的工具支撑。
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华大智造基于全新技术打造的最新款基因测序仪DNBSEQ-G99,助力此次溯源测序在短时间内得到了高度可信的毒株序列全长。面对qPCR检测Ct值为21左右的样本时,三种不同读长宏基因组测序统计猴痘病毒特异性reads平均约占0.35%。分析结果显示在读长为SE40时,猴痘病毒基因组平均深度约为35X;SE100时,其平均深度约为110X;PE100时,其平均深度约为200X,100X以上覆盖度大于99.03%。
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