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用户测评丨江汉大学基于DNBSEQ平台的MNP技术在多病原监测中的应用

时间:2023-12-25作者:华大智造阅读数:1267分享

进入秋冬季节以来,我国急性呼吸道疾病持续上升。监测显示,呼吸道感染性疾病的病原以流感病毒为主,此外还有鼻病毒、肺炎支原体、呼吸道合胞病毒、腺病毒等,呈多种呼吸道病原体叠加态势。多病原监测结果提示,不同年龄群体流行的主要病原体不同;不同地区省份的呼吸道传染病流行强度和周期也不同。高效准确地进行多病原检测与监测对于呼吸道疾病的治疗和防控至关重要。


江汉大学彭海教授团队基于华大智造DNBSEQ-G99测序平台,开发了呼吸道多病原鉴定MNP标记技术,可同时监测132种呼吸道病原体,并精细溯源至单碱基变异。2022年-2023年,江汉大学与湖北省疾控中心联合探索性开展MNP技术在传染病领域的应用研究,并分别在武汉、恩施、咸宁等地市疾控机构和医疗机构开展呼吸道多病原鉴定MNP标记技术的试点应用,采用“多病同防”策略进行病原体精准识别,提升了全省秋冬季传染病防控工作技术水平。


图1 .MNP技术原理及测序分析流程


12月25日,呼吸道多病原鉴定MNP标记技术负责人、江汉大学高利芬博士,在华大智造第六期DNBSEQ-G99线上分享会上进行了《基于DNBSEQ测序平台的MNP技术在多病原鉴定中的应用》的报告,MNP技术发明人江汉大学彭海教授参与了线上的技术交流和答疑。


传统的多病原监测方法只能监测几种到十余种病原体,并且只能判断病原体的有无,难以监测病原体流行演变。MNP病原谱监测技术面向流行病监测需求开发,不仅能全面、精准和灵敏的检测病原体的有无,还能满足病原体定量、精细溯源等特殊需求。


图2. MNP标记技在术DNBSEQ-G99平台的检测、定量性能重复性测试


目前,该技术已经完成在DNBSEQ-G99测序平台的适配,并进行了多轮真实样本测试,表现出良好的病原体鉴定准确性、定量能力和溯源能力。DNBSEQ-G99是中小通量领域测序速度最快机型之一,可以在12小时完成PE150读长测序,极大地提升了MNP标记技术的使用效率,同时特有的多时点数据输出模式(bioanalysis by sequencing, BBS),可实现病原快速识别,节省宝贵的防控时间。



图3 .MNP标记检出的病原变异与进化分析


秉承“创新智造引领生命科技”的理念,在公共卫生领域,华大智造已形成病原微生物宏基因组测序、靶向测序、全基因组测序等应用场景的全流程产品组合,满足新冠病毒、流感病毒、猴痘病毒、登革热病毒等病原微生物全基因组测序和溯源需求,持续助力传染病防控和公共卫生能力建设。


未来,华大智造还将继续联合行业研究机构与企业生态伙伴,不断拓展DNBSEQ测序技术在病原微生物研究和传染病防控领域的应用场景,为公共卫生事件的监测和预警提供更自动、更便捷、更高效的自主核心工具。

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