基因测序

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新冠疫情

背景

了解病毒进入新种群后的进货和传播方式对于设计有效的疾病控制和预防策略至关重要。研究人员使用了宏基因组测序和多重PCR扩增子测序的方法,从65例COVID-19病毒感染患者的临床样本中获取新冠病毒基因组序列,并结合流行病学数据对某省新型冠状病毒基因组流行病学进行了研究。


方案

采集65例新冠病毒感染病例79份临床样本,提取RNA后进行宏转录组测序文库构建,然后使用华大智造的高通量测序平台进行测序。


结果

本次研究获得53个新型冠状病毒基因组序列,研究发现,相同CT值下华大智造高通量测序平台的宏基因组测序方法完成的新冠病毒基因组数据更容易拼接组装为完整的基因组。


文章

Genomic epidemiology of SARS-CoV-2 in

Guangdong Province, China.

期刊名称:Cell

发表时间:2020年4月