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【智造微课】CoolMPS到底有多酷?
时间:2020-04-17作者:华大智造阅读数:763分享

第一期智造微课为您全方位讲解了“CoolMPS到底有多酷”,下文将为您梳理CoolMPS课程干货。


CoolMPS为什么酷?

错配率作为高通量测序中测序数据质量的重要反映指标,反映着测序质量的优劣。通过与其他平台的对比,可以惊喜发现,华大智造MGISEQ-2000 CoolMPS测序数据的Mismatch rate随cycle数的变化,始终维持在一个较为平稳的低值。



CoolMPS技术原理

CoolMPS测序过程,即首先引入未标记可逆终止核苷酸,随后使用荧光标记的能与3'-阻断的核苷酸特异结合的抗体进行碱基识别。切除3'-阻断基团后,结合的抗体从核苷酸上掉落下来,再生天然核苷酸,由此形成循环往复。



这种恢复到天然核苷酸的特性允许在新的测序循环中进一步延伸,而不受前一个循环的任何干扰。此外,无标签的RTs(可逆终止子)更容易制备,可以更有效的被聚合。另一个优点是与标准标记RTs的单个染料相比,抗体可以携带同一染料的多个分子,从而大大增加了测序信号。



CoolMPS用户数据

以CoolMPS国内用户在WGS、WES和肿瘤Panel等应用的实测数据为例,基于DNBSEQ平台的CoolMPS测序结果显示,平均Q30至少提升了5%,Mismatch rate降低了50%以上,能够检测到更多突变位点,而且对于超低频突变的标准品测试验证结果优秀(检出率高达92.3%)。












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