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【智造微课】DNBelab C4,让单细胞实验室装进口袋
时间:2020-06-11作者:华大智造阅读数:122分享

单细胞组学已广泛应用于基础科研和临床前研究,通过单细胞测序可以有效研究组织的异质性,发现新的细胞群和细胞亚群,极大的促进了我们对细胞特性、状态、多样性和功能的理解。本文将与您分享如何基于便携式单细胞系统DNBelab C4开展单细胞组学研究,以及基于该系统能够开展开哪些应用。


一、为什么需要单细胞组学研究?

组织包含各种细胞类型及细胞中间态,若使用群体测序方法,只可以得到组织细胞类型的基因表达均值,无法体现特定或少量细胞类型的基因表达信息。而单细胞测序技术可以检测单个细胞的基因表达谱,能够有效开展组织异质性研究,提升研究分析的精准度



二、便携式单细胞系统DNBelab C4

由于单细胞组学研究较大程度依赖相关仪器,且研究成本较高,因此在一定程度上限制了单细胞领域的科研探索以及应用转化。


在此背景下,华大智造推出了便携式单细胞系统DNBelab C4 ,DNBelab C4 小巧轻便,无需电源,重量不到220g,操作简单,可随时开始单细胞建库,同时可有效降低单细胞建库成本。



该系统拥有:

1. 低双胞率

2. 稳定的基因检测能力

3. 高效捕获转录本及稀有细胞类型


可支持手工建库或使用MGISP系列自动化建库,基于DNBSEQ测序平台检测,能够获得更高质量数据。对于已在其他测序平台上开展的研究项目,也可支持多平台数据整合分析




三、DNBelab C4可支持的应用

DNBelab C系列细胞组学整体解决方案,包含DNBelab C便携式单细胞系统、DNBelab C系列单细胞文库制备套装以及DNBelab C系列单细胞分析工具包。基于便携式单细胞系统DNBelab C4,可以支持High-throughput 3' scRNA-seq、High-throughput scATAC-seq等,同时在Multi-omics approaches等领域也已经开展相关探索及开发。




近期一项研究[1] 利用DNBelab C4便携式单细胞系统,对食蟹猴的主要组织器官(肺、肾脏、肝、胰腺、大脑、主动脉、甲状腺、腮腺和血液)进行单细胞转录组测序,建立了食蟹猴单细胞转录组数据库,鉴定出44种食蟹猴的主要细胞类型,在国际上首次完成构建非人灵长类单细胞图谱。



四、千万单细胞转录组计划

在2019年华大智造拉脱维亚基地开幕仪式上正式启动“1000万单细胞转录组计划(10 Million Single-cell Transcriptome Project, scT10M)”,该计划将利用DNBSEQ平台以及DNBelab C系列等高通量、高精准度的单细胞测序研究工具和策略,对人类和其他物种开展单细胞测序和分析,并与科学界共享数据和研究成果。scT10M计划的合作伙伴已包括英国、德国、丹麦等国家的科学家,目前开放招募合作,如有兴趣可与我们联系(邮箱 P_sc10M@genomics.cn)。


参考文献:

【1】Single-cell atlas of a non-human primate reveals new pathogenic mechanisms of COVID-19







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